Diversity of Benzylsuccinate Synthase-Like (bssA) Genes in Hydrocarbon-Polluted Marine Sediments Suggests Substrate-Dependent Clustering

Abstract

The potential of hydrocarbon biodegradation in marine sediments was determined through the detection of a functional biomarker, the bssA gene, coding for benzylsuccinate synthase, the key enzyme of anaerobic toluene degradation. Eight bssA clone libraries (409 sequences) were constructed from polluted sediments affected by the Prestige oil spill in the Atlantic Islands National Park and from hydrocarbon-amended sediment microcosms in Mallorca.

El potencial de biodegradación de hidrocarburos en sedimentos marinos se determinó mediante la detección de un biomarcador funcional, el gen bssA , que codifica la bencilsuccinato sintasa, enzima clave en la degradación anaeróbica del tolueno. Se construyeron ocho bibliotecas de clones bssA (409 secuencias) a partir de sedimentos contaminados afectados por el vertido del Prestige en el Parque Nacional de las Islas Atlánticas y de microcosmos de sedimentos modificados con hidrocarburos en Mallorca. Los productos amplificados y las secuencias similares a bssA derivadas de la base de datos se agruparon en cuatro grupos principales, según se determinó mediante reconstrucción filogenética, análisis de coordenadas principales (PCoA) y una herramienta de predicción de subfamilias.