Bioprospección en actinobacterias cultivables de las riberas del río Arauca (Colombia)

Abstract

Esta investigación tiene su enfoque principal en las actinobacterias extraídas a partir de sedimentos de las riberas del río Arauca en Colombia, como microorganismos productores de compuestos potencialmente bioactivos. Para el tratamiento de los sedimentos y asilamiento de actinobacterias, fueron utilizados cinco pretratamientos físico-químicos (Carbonato de Calcio-C, Fenol-F, Térmico-T, Microondas-M, Sonicación-U) y dos clases de medio de cultivo selectivos (agar de Ácido Húmico y agar-avena ISP3). Un total de 790 aislados de actinobacterias fueron obtenidos. Todos los aislados fueron incluidos en la colección biológica de microorganismos de la Universidad de La Sabana (ActinosUsab). A partir de esta colección biológica se realizó una estrategia de dereplicación biológica por embudo, mediante ensayos antimicrobianos por confrontación directa. La totalidad de aislados de actinobacterias fueron llevados a ensayos de confrontacion directa frente a 4 bacterias patógenas: Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus-MRSA, Enterococcus faecium-VRE y Bacillus subtilis. Los asilados con actividad antibacterial positiva fueron luego llevados a ensayos de confrontación directa frente a 3 aislados clínicos de hongos dermatofitos: Cladosporium cladosporioides, Cladosporium cladosporioides y Epicoccum nigrum. En total, 78 aislados de actinobacterias (9.87%) del 790 total inicial fueron seleccionados mediante esta estrategia de dereplicación biológica, al presentar actividad antibacterial y antifúngica. Estos aislados fueron analizados mediante secuenciación de 16S rRNA, confirmando su pertenencia a la familia Streptomycetaceae. Los 78 aislados seleccionados, fueron llamados “aislados bioactivos”. Se encontró que estos aislados en su mayoría provenían de cultivos con sedimentos pretratados con fenol (F), procesos de sonicación (U) y exposición a microondas (M) durante su proceso de aislamiento.