%0 Generic
%A Gamez, Rocío M.
%A Rodríguez, Fernando
%A Vidal, Newton Medeiros
%A Ramirez, Sandra
%A Vera Alvarez, Roberto
%A Landsman, David
%A Mariño-Ramírez, Leonardo
%8 2019
%@ 14712164
%U http://hdl.handle.net/10818/62287
%X Background: Banana is one of the most important crops in tropical and sub-tropical regions. To meet the demands of international markets, banana plantations require high amounts of chemical fertilizers which translate into high farming costs and are hazardous to the environment when used excessively. Beneficial free-living soil bacteria that colonize the rhizosphere are known as plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR). PGPR affect plant growth in direct or indirect ways and hold great promise for sustainable agriculture. Results: PGPR of the genera Bacillus and Pseudomonas in banana cv. Williams were evaluated. These plants were produced through in vitro culture and inoculated individually with two rhizobacteria, Bacillus amyloliquefaciens strain Bs006 and Pseudomonas fluorescens strain Ps006. Control plants without microbial inoculum were also evaluated. These plants were kept in a controlled climate growth room with conditions required to favor plant-microorganism interactions. These interactions were evaluated at 1-, 48- and 96-h using transcriptome sequencing after inoculation to establish differentially expressed genes (DEGs) in plants elicited by the interaction with the two rhizobacteria. Additionally, droplet digital PCR was performed at 1, 48, 96 h, and also at 15 and 30 days to validate the expression patterns of selected DEGs. The banana cv. Williams transcriptome reported differential expression in a large number of genes of which 22 were experimentally validated. Genes validated experimentally correspond to growth promotion and regulation of specific functions (flowering, photosynthesis, glucose catabolism and root growth) as well as plant defense genes. This study focused on the analysis of 18 genes involved in growth promotion, defense and response to biotic or abiotic stress. Conclusions: Differences in banana gene expression profiles in response to the rhizobacteria evaluated here (Bacillus amyloliquefaciens Bs006 and Pseudomonas fluorescens Ps006) are influenced by separate bacterial colonization processes and levels that stimulate distinct groups of genes at various points in time. © 2019 The Author(s).
%X Antecedentes: El banano es uno de los cultivos más importantes en las regiones tropicales y subtropicales. Para satisfacer las demandas de los mercados internacionales, las plantaciones de banano requieren altas cantidades de fertilizantes químicos que se traducen en altos costos agrícolas y son peligrosos para el medio ambiente cuando se usan en exceso. Las bacterias beneficiosas del suelo de vida libre que colonizan la rizosfera se conocen como rizobacterias promotoras del crecimiento de las plantas (PGPR). Los PGPR afectan el crecimiento de las plantas de manera directa o indirecta y son muy prometedores para la agricultura sostenible. Resultados: PGPR de los géneros Bacillus y Pseudomonas en banano cv. Williams fueron evaluados. Estas plantas fueron producidas mediante cultivo in vitro e inoculadas individualmente con dos rizobacterias, Bacillus amyloliquefaciens cepa Bs006 y Pseudomonas fluorescens cepa Ps006, así como plantas testigo sin inóculo microbiano. Estas plantas se mantuvieron en una sala de crecimiento de clima controlado con las condiciones requeridas para favorecer las interacciones planta-microorganismo. Estas interacciones se evaluaron a las 1, 48 y 96 h utilizando la secuenciación del transcriptoma después de la inoculación para establecer genes expresados diferencialmente (DEGs) en plantas provocados por la interacción con las dos rizobacterias. Además, se realizó una PCR digital en gotas a 1, 48, 96 h, y también a los 15 y 30 días para validar los patrones de expresión de los DEG seleccionados. El plátano cv. El transcriptoma de Williams reportó expresión diferencial en un gran número de genes, de los cuales 22 fueron validados experimentalmente. Los genes validados experimentalmente corresponden a la promoción del crecimiento y la regulación de funciones específicas (floración, fotosíntesis, catabolismo de la glucosa y crecimiento radicular), así como a los genes de defensa de las plantas. Este estudio se centró en el análisis de 18 genes implicados en la promoción del crecimiento, la defensa y la respuesta al estrés biótico o abiótico. Conclusiones: Las diferencias en los perfiles de expresión génica del banano en respuesta a las rizobacterias aquí evaluadas (Bacillus amyloliquefaciens Bs006 y Pseudomonas fluorescens Ps006) están influenciadas por procesos y niveles de colonización bacteriana separados que estimulan distintos grupos de genes en varios puntos en el tiempo. © 2019 El Autor(es).
%I BMC Genomics
%T Banana (Musa acuminata) transcriptome profiling in response to rhizobacteria: Bacillus amyloliquefaciens Bs006 and Pseudomonas fluorescens Ps006
%T Perfil del transcriptoma del plátano (Musa acuminata) en respuesta a rizobacterias: Bacillus amyloliquefaciens Bs006 y Pseudomonas fluorescens Ps006
%R 10.1186/s12864-019-5763-5
%~ Intellectum